Eksplorasi Senyawa Penghambat Enzim Salisilat Sintase dari Mycobacterium tuberculosis melalui Studi Penambatan Molekul dan Prediksi Sifat ADME

Abstrak

Munculnya Mycobacterium tuberculosis (MTB) yang resisten terhadap berbagai obat telah menjadi masalah utama dalam pengobatan tuberkulosis (TB) sehingga sangat dibutuhkan penemuan obat baru untuk pengendalian TB yang lebih baik. Penelitian ini bertujuan untuk menemukan inhibitor potensial terhadap salisilat sintase MTB, yang mengontrol biosistesis mikobaktin untuk mengikat ion besi agar bakteri dapat bereplikasi dengan menggunakan metode penambatan molekul. Sebanyak 462 senyawa dari database Marine Natural Product dipilih dan dilakukan penyaringan senyawa berdasarkan berat molekul dan energi afinitas pengikatan secara berurutan. Hasil analisis berdasarkan energi ikatan dan interaksi molekuler, termasuk ikatan hidrogen dan interaksi hidrofobik, senyawa CMNPD18535 (xylogranatin H), CMNPD20622 (agallochoal O), CMNPD25719 (isoscutellarein 7-O-β-xyloside-2′′-O-sulfate), dan CMNPD31560 (28-nor-olean-2a,3ß-dihydroxy-14,17-diene-16-one) dipilih sebagai senyawa hit. Keempat senyawa tersebut menunjukkan kapasitas terbesar untuk menghambat enzim salisilat sintase dengan energi pengikatan berturut-turut sebesar -10,33, -10,1, -10,03 dan -9,76 kkal/mol dibandingkan dengan RVE (ligan alami) dengan energi sebesar -8,15 kkal/mol. Secara umum, senyawa hit menunjukkan profil keamanan dan kriteria Lipinski yang relatif baik, kecuali CMNPD20622 karena menghambat enzim CYP2C9 dan CYP3A4, dan CMNPD25719 yang memiliki kelebihan donor dan akseptor hidrogen, sehingga melanggar 2 kriteria Lipinski sebagai obat oral. Studi ini dapat menjadi langkah awal dalam memilih kandidat senyawa yang tepat untuk analisis eksperimental lebih lanjut sebagai alternatif penghambat sintase salisilat MTB.

Kata kunci

• M. tuberculosis
• Mikobaktin
• penambatan molekul
• salisilat sintase